¿Cómo instalar y cargar paquetes en R?

R es modular ya que consta de un núcleo básico de programas para realizar operaciones, gráficos y análisis. Estos programas vienen incluidos en el paquete de instalación. No obstante, existe un repositorio denominado CRAN (Comprehensive R Archive Network) donde constantemente se van agregando nuevos paquetes para expandir las funcionalidades de R.

IMPORTANTE Para poder acceder a estos paquetes extra, primero es necesario instalarlos en nuestro sistema y luego, cuando los necesitemos, cargarlo en la sesión de trabajo.

Para esto tenemos 3 alternativoas:

1. Funciones install.packages()/library()
2. Paquete pacman (recomendada)
3. Panel Packages de RStudio

A continuación se muestra un ejemplo para instalar los paquetes nortest y moments

Alternativa 1: install.packages()/library()

Si queremos instalar uno paquetes necesitamos correr por única vez la función install.packages() indicando el nombre del paquete entre comillas:

# Un solo paquete
install.packages("moments")

Si queremos instalar varios paquetes a la vez podemos crear un vector que contenga los nombres de los paquetes y usarlo como argumento en la función.

# Varios paquetes
paquetes <- c("nortest", "moments")
install.packages(paquetes)

Una vez instalados, los paquetes se deben cargar en el entorno o sesión de trabajo usando la función library().

# Cargar el paquerte agricolae
library(moments)

A diferencia de install.packages(), la carga de los paquetes es individual, es decir, debejos ejecutar library() por cada paquete que querramos cargar.

Alternativamente si queremos usar alguna función específica sin cargar el paquete entero podemos usar ::. Por ejemplo, lara usar la función skewness() del paquete moments podemos hacer

moments::skewness(x)

Si por alguna circunstancia queremos removerlo del entorno de trabajo (no del sistemaa), es necesario usar la función detach()

# Para remover el paquete moments
detach("package:moments", unload = T)

Finalmente si queremos desinstalarlo de nuestra máquina, es necesario usar la función remove.packages()

# Para remover el paquete moments
remove.packages("moments")

Alternativa 2: pacman

El proceso anterior se puede simplificar usando el paquete pacman. Pero primero hay que instalarlo por única vez usando install.packages():

install.packages("pacman")

Luego, cuando queremos usar un paquete o varios paquetes podemos llamarlos usando p_load():

pacman::p_load(moments, nortest)  # no necesitamos usar comillas

Esta función por defecto va a chequear si el o los paquetes indicados están instalados antes de cargarlos. Si algun paquete no está instalado, lo instala y después lo carga. Eso se controla con el argumento install = FALSE.

Para chequear si un paquete esta cargado:

pacman::p_isloaded(x)

Para remover un paquete de la sesion

pacman::p_unload(x)

Para remover algun paquete de nuestra biblioteca

pacman::p_delete(x)

Para buscar un paquete por el nombre, o alguna parte de él

pacman::p_search_library("tidy")

Alternativa 3: Panel Packages de RStudio

RStudio cuenta con un panel desde donde podemos instalar y cargar paquetes. En ambos casos RStudio corre las funciones install.packages() y library().

Figure 1: Panel Packages

Para instalar por primera vez los paquetes se puede utilizar el ícono Install que abre el siguiente cuadro de diálogo.

Figure 2: Cuadro de diálogo para instalar paquetes

Por defecto, RStudio buscará e instalará los paquetes desde CRAN. En Packages hay que ingresar los nombres de los paquetes separados por comas. RStudio ofrece la posibilidad de ir completando el nombre si no nos acordamos.

Finalmente, para cargar los paquetes podemos usar el panel Packages, buscar el paquete que queremos y tildar la casilla.

¿library(), pacman o panel Packages?

Si bien el panel Packages brinda una interfase para seleccionar y cargar los paquetes con un click, esta alternativa tiene una desventaja: hay que acordarse en futuras sesiones que es necesario cargar ese paquete. Es por eso que incluir un par de líneas en el script con la función library() o pacman::p_load()es mejor. pacman tiene la ventaja extra de chequear si el paquete está instalado o no.